More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3112 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
458 aa  952    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  61.3 
 
 
452 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  60.85 
 
 
451 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  58.69 
 
 
446 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  58.37 
 
 
441 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 
458 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
462 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
455 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  27.29 
 
 
436 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 
436 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
460 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
434 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
462 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 
478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 
448 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 
459 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
451 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
451 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 
435 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 
476 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  27.43 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 
471 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
447 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 
451 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  23.25 
 
 
463 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  22.51 
 
 
464 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 
449 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
435 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  25.06 
 
 
437 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 
481 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 
434 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  21.24 
 
 
457 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
484 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  22.93 
 
 
518 aa  97.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 
483 aa  93.6  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  23.34 
 
 
428 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 
427 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
490 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 
476 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 
444 aa  86.7  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  22.93 
 
 
501 aa  83.6  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  22.45 
 
 
477 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  24 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
499 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  22.92 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 
423 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  22.47 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  23.88 
 
 
468 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  33.53 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  22.65 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 
424 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  22.2 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  21.71 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 
445 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 
347 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  23.72 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 
459 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  21.92 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  28.74 
 
 
325 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 
459 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 
383 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 
350 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 
359 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 
355 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  23.83 
 
 
459 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 
350 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>