More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0812 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 445 aa  931    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  57.56 
 
 		 452 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  59.91 
 
 		 447 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1134  oxidoreductase domain protein  61.75 
 
 		 442 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0037  oxidoreductase domain protein  48.18 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  41.28 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2873  oxidoreductase domain protein  43.53 
 
 		 419 aa  333  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000305709  normal  0.0375286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1606  oxidoreductase domain protein  41.61 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.687359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  38.35 
 
 		 428 aa  286  8e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0111  oxidoreductase domain protein  37.33 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.480309  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1216  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  22.36 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  23.49 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  20.46 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  23.48 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.36 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.24 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  25.51 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  27.98 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  23.99 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.03 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  28.38 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  22.76 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  25.47 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  27.95 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.47 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  25.47 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.54 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  23.54 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 		 329 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  25.47 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  25.47 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.54 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  23.26 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  20.62 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.08 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.17 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  24.32 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  26.49 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  23 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  24.61 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  25.96 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  23.61 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  25.65 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  29.45 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1579  oxidoreductase domain-containing protein  25.62 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  25.65 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  25.65 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  24.24 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  25.65 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  25.65 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  26.03 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  23.29 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  24.67 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4569  oxidoreductase domain-containing protein  23.95 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.91 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  23.18 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  23.24 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.28 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>