More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5067 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  69.76 
 
 		 447 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 452 aa  948    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1134  oxidoreductase domain protein  64.47 
 
 		 442 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  57.56 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0037  oxidoreductase domain protein  50.22 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1606  oxidoreductase domain protein  44.34 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.687359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  39.55 
 
 		 435 aa  327  4.0000000000000003e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2873  oxidoreductase domain protein  43.12 
 
 		 419 aa  305  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000305709  normal  0.0375286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  40.72 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0111  oxidoreductase domain protein  35.32 
 
 		 475 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.480309  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1216  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 		 457 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  21.52 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  24.49 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  25.47 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  23.99 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  31.21 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 330 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  22.8 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.66 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  24 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  22.57 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  26.11 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  22.32 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  22.32 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  22.42 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.77 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  26.11 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  25.16 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  28.07 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  26.75 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  25.99 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  24.36 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  23.93 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.46 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.13 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  32.67 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  32.67 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  18.87 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  23.79 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  32.67 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  25.25 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  29.61 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  29.61 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  25.71 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  22 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  23.06 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  23.57 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  26.22 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  27.1 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  22 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  27.17 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  32 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>