More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1134 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1134  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 442 aa  921    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  66.89 
 
 		 447 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  64.47 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  61.75 
 
 		 445 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0037  oxidoreductase domain protein  51.01 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1606  oxidoreductase domain protein  44.71 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.687359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  41.42 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2873  oxidoreductase domain protein  44.02 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000305709  normal  0.0375286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0111  oxidoreductase domain protein  38.11 
 
 		 475 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.480309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  39.95 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1216  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 421 aa  93.2  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.42 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  23.65 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  21.65 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  23.61 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  24.41 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  29.18 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  22.59 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  23.09 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  23.55 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  29.18 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  24.25 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  26.55 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  20.04 
 
 		 477 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  25.27 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  24.74 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.49 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  24.15 
 
 		 458 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  22.97 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  25.2 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  25.29 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  22.88 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  23.05 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  27.09 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.14 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  24.35 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  22.55 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  22.22 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  26.91 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  25.14 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  28.66 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.07 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.14 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.14 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.07 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  26.34 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  25.74 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.07 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  25.14 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  25.14 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  24.65 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.86 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.7 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.15 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.3 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.37 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  25.42 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.17 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  23.57 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  25.54 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  22.58 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.69 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  22.47 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>