101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0111 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0111  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 475 aa  999    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.480309  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0037  oxidoreductase domain protein  37.42 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  37.09 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  37.33 
 
 		 445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  35.32 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1134  oxidoreductase domain protein  38.11 
 
 		 442 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1606  oxidoreductase domain protein  32.96 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.687359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2873  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000305709  normal  0.0375286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  30.7 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1216  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  24.73 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  22.44 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  21.75 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  23.83 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.15 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  24.33 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  25.37 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  21.81 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  21.03 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  22.55 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  22.6 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  22.09 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  23.73 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.8 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  23.79 
 
 		 365 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  23.89 
 
 		 326 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  23.57 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  19.87 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  23.67 
 
 		 355 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  24.56 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  28.99 
 
 		 337 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  22.45 
 
 		 421 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 		 361 aa  53.5  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 		 501 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 		 447 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.44 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  21.09 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  21.73 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.31 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  23.63 
 
 		 317 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  22.04 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  27.59 
 
 		 345 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  22.16 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  24.29 
 
 		 336 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  22.64 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  26.76 
 
 		 347 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  23.11 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  26.9 
 
 		 345 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  26.9 
 
 		 345 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 		 349 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 337 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  23.95 
 
 		 328 aa  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  23.68 
 
 		 342 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.09 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  23.85 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  26.9 
 
 		 345 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  26.9 
 
 		 345 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  26.9 
 
 		 345 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 368 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 366 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 360 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 360 aa  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  24 
 
 		 366 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  19.19 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  21.12 
 
 		 406 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  23.34 
 
 		 345 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  23.74 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  21.97 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  26.34 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  23.15 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.26 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3402  oxidoreductase, putative  22.71 
 
 		 338 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  23.77 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  21.07 
 
 		 335 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  26.34 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  23.37 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  23.9 
 
 		 350 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00860  conserved hypothetical protein  23.9 
 
 		 352 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0324614  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  21.56 
 
 		 363 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.14 
 
 		 311 aa  44.3  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  23.97 
 
 		 323 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  23.36 
 
 		 330 aa  43.9  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  23.68 
 
 		 360 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 		 366 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  20.87 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 310 aa  43.5  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  21.37 
 
 		 329 aa  43.1  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.21 
 
 		 362 aa  43.1  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  21.3 
 
 		 471 aa  43.1  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>