More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1606 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1606  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 435 aa  902    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.687359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2873  oxidoreductase domain protein  56.16 
 
 		 419 aa  488  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000305709  normal  0.0375286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  49.06 
 
 		 435 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0037  oxidoreductase domain protein  43.05 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  44.34 
 
 		 452 aa  339  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  43.15 
 
 		 447 aa  326  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  41.61 
 
 		 445 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1134  oxidoreductase domain protein  44.71 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1216  oxidoreductase domain protein  37.85 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  37.83 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0111  oxidoreductase domain protein  32.96 
 
 		 475 aa  229  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.480309  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  23.73 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  28.3 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  23.32 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  27.24 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  27.24 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  27.24 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  27.24 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  27.24 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  26.88 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 		 342 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 326 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  25.34 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.25 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  26.89 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  26.73 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  29.65 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  25.11 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.08 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.71 
 
 		 357 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  21.71 
 
 		 496 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.73 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  24.57 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  26.27 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.73 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  26.27 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  24.19 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  24.19 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  26.27 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  24.19 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  24.19 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  26.88 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  25.38 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  22.49 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.69 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  24.55 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  25.85 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  32.37 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  22.88 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  28.93 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  23.36 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  23.45 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>