More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0297 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  75.11 
 
 		 485 aa  736    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 459 aa  954    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  53.41 
 
 		 460 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  46.02 
 
 		 462 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  48.25 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  45.59 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  35.15 
 
 		 450 aa  259  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 448 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 484 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  35.74 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  31.46 
 
 		 476 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 462 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 439 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 483 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  33.7 
 
 		 473 aa  136  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 452 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  34.4 
 
 		 444 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  34.16 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  34.16 
 
 		 499 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  30.33 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 446 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 471 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 457 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 406 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 477 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 451 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 459 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 421 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 435 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.06 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 501 aa  96.7  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 362 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 480 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 		 356 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 364 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  21.7 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  32.53 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  31.97 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  32.43 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  31.01 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  27.54 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  30 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  24.82 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.2 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  31.08 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.21 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  25.93 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>