More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1237 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  72.71 
 
 		 435 aa  675    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 434 aa  910    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  36.06 
 
 		 455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  35.12 
 
 		 451 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  34.89 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  35.43 
 
 		 458 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  33.94 
 
 		 436 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  31.59 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 439 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 449 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 476 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 		 451 aa  186  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 457 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 501 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  29.53 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 		 471 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 462 aa  156  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 478 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 428 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 477 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 464 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 485 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  27.29 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 		 483 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 469 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  27.09 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  24.26 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  22.84 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 446 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  41.09 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  23.66 
 
 		 364 aa  90.5  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 350 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  22.72 
 
 		 403 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  35.37 
 
 		 312 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 355 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 350 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  24.47 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  24.2 
 
 		 337 aa  86.7  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  24.2 
 
 		 337 aa  86.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.88 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.06 
 
 		 359 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  24.46 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  33.78 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  31.22 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  23.63 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 349 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  20.36 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  22.1 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  34.67 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  23.83 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  23.83 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>