More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2671 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  65.3 
 
 		 481 aa  677    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  67.23 
 
 		 487 aa  669    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 484 aa  998    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  68.94 
 
 		 473 aa  709    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  54.49 
 
 		 499 aa  522  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  54.04 
 
 		 476 aa  505  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  51.69 
 
 		 483 aa  485  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  49.59 
 
 		 490 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  44.92 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  38.32 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  40.79 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  34.85 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 		 468 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 459 aa  204  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  37.09 
 
 		 423 aa  173  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  38.11 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 451 aa  156  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  28.1 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  36.82 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 459 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  34.7 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 		 483 aa  137  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 464 aa  136  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 462 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  34.93 
 
 		 471 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 428 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  31.83 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  32 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  33.81 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  32.75 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  34.05 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 451 aa  126  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  34.05 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  31.92 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 		 447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  33.95 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 501 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 403 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 458 aa  97.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 406 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 446 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  31.74 
 
 		 680 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  31.54 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  29.12 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.78 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  33.91 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  27.09 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>