More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1352 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 445 aa  925    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  49.22 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  48.67 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  49.44 
 
 		 440 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  48.44 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  43.12 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  40.18 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  37.42 
 
 		 480 aa  285  9e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 		 434 aa  257  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  32.44 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 501 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  30.02 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 476 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  29.2 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 477 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 481 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  35.09 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 439 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 444 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  35.38 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 447 aa  136  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 476 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 		 452 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 449 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 468 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  32.84 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 478 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 403 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  24.41 
 
 		 444 aa  97.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  23.73 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  23.71 
 
 		 458 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  26.37 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  23.98 
 
 		 452 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 459 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  25.72 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.76 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  25.72 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  25.72 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  25.72 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 		 367 aa  86.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  23.1 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  30.06 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  35.38 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  23.62 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>