More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4732 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
427 aa  898    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 
448 aa  245  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  33.78 
 
 
449 aa  233  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 
434 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  33.26 
 
 
421 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  32.9 
 
 
464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 
436 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  29.4 
 
 
436 aa  219  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 
435 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
476 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 
448 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 
435 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
440 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  29.4 
 
 
439 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 
447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  31.59 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 
428 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 
451 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 
451 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  28.87 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
457 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  29.98 
 
 
424 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
444 aa  183  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
435 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
481 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 
423 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
499 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 
483 aa  172  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 
458 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
484 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  29 
 
 
501 aa  163  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 
445 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 
471 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 
469 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
483 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
444 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 
444 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 
428 aa  149  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 
473 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
485 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
480 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 
462 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  36.74 
 
 
487 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 
459 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
403 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
476 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
478 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 
462 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 
460 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  32.34 
 
 
450 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 
406 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  23.7 
 
 
441 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 
452 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
451 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  22.37 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  26.41 
 
 
458 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
459 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 
459 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 
459 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 
459 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.17 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  30.73 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  33.9 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  30.17 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  30.17 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  30.27 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
372 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.85 
 
 
317 aa  79  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 
680 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  26.92 
 
 
336 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.55 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 
467 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  30.91 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.64 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.58 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  38.81 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>