More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2325 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  100 
 
 
450 aa  939    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  37.34 
 
 
462 aa  299  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  36.6 
 
 
460 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 
478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  36.52 
 
 
462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  34.44 
 
 
459 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  35.67 
 
 
485 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
455 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
476 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
434 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
441 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  32.96 
 
 
484 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
435 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  26.12 
 
 
440 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 
439 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 
421 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
446 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  24.33 
 
 
457 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  25.39 
 
 
436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 
451 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 
480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 
448 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 
458 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  32.84 
 
 
445 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 
449 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 
434 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
471 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
406 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 
428 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
499 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
483 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 
403 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 
444 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  28.7 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 
464 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  23.11 
 
 
447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 
501 aa  112  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 
423 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 
476 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
477 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
469 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 
444 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 
490 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 
487 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  30.55 
 
 
444 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
447 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 
432 aa  97.4  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 
463 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.96 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 
336 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 
518 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  28.39 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 
349 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.47 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.03 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  28 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.19 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  30.07 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  33.78 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.87 
 
 
335 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  22.94 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>