More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3765 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 518 aa  1076    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 406 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  22.93 
 
 		 458 aa  97.1  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 462 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 448 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  25.3 
 
 		 452 aa  90.5  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 444 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 485 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  21.7 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  32.09 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.84 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  22.55 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 		 462 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.84 
 
 		 329 aa  76.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  37.96 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.89 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  31.67 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 342 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  25.54 
 
 		 455 aa  73.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 		 364 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 345 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 435 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.06 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  22.34 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  30.25 
 
 		 346 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  30.25 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 345 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  30.25 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  30.25 
 
 		 346 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  30.25 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  30.51 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.12 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  24.82 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  25.95 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.36 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  24.47 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  35.45 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.65 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.18 
 
 		 312 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  34.21 
 
 		 346 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  29.41 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 390 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  31.09 
 
 		 346 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  26.78 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  33.63 
 
 		 358 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  37.07 
 
 		 315 aa  70.1  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  23.47 
 
 		 421 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  34.21 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  32.47 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.98 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  35.79 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  22.59 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  29.66 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  32.48 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  22.59 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  33.96 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  26.23 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  23.47 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  20 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  22.28 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>