More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1741 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 462 aa  938    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  53.48 
 
 		 460 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  47.65 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  46.02 
 
 		 459 aa  438  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  46.88 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  46.88 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  36.9 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 		 452 aa  233  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 		 441 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  26.75 
 
 		 458 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  36.67 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  32.09 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 440 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 464 aa  127  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  33 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  28.3 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 		 477 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 447 aa  116  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  33.71 
 
 		 459 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 483 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  25.05 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 518 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.87 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  37.41 
 
 		 352 aa  92.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  29 
 
 		 459 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 		 459 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  29 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  33.74 
 
 		 363 aa  90.1  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.7 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  35.07 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  36.3 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  39.33 
 
 		 344 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.7 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 		 345 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  35.4 
 
 		 337 aa  86.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 467 aa  86.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  30.68 
 
 		 336 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  34.72 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  40.41 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  33.66 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>