More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2857 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 447 aa  935    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  43.02 
 
 		 444 aa  359  6e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  44.3 
 
 		 444 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  41.12 
 
 		 490 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  40.25 
 
 		 499 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  44.1 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  39.38 
 
 		 481 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  38.32 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  38.24 
 
 		 483 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  40.09 
 
 		 435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  37.32 
 
 		 476 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  37.61 
 
 		 487 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 		 473 aa  286  7e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  34.44 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 		 468 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  29.01 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  26.08 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  34.08 
 
 		 483 aa  136  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 458 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  32.81 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 451 aa  130  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  25.05 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 476 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 462 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  23.18 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  24.13 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  23.62 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  38.98 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  33.88 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  31.08 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  34.45 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  23.31 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.41 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  34.17 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  31.72 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  29.31 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 		 328 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  34.43 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  31.15 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  33.6 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>