More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4144 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 435 aa  903    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  69.61 
 
 		 434 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  42.29 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  39.58 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  38.37 
 
 		 451 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  38.96 
 
 		 448 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  38.8 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 		 457 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  35.01 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 		 480 aa  243  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 		 421 aa  240  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 		 476 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  31.57 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 501 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  31.26 
 
 		 455 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  31.57 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 435 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 462 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 471 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 484 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 428 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 473 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 476 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  26.52 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 444 aa  133  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  28.01 
 
 		 432 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  29.71 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 		 460 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  28.39 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 		 458 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 468 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 459 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 463 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.3 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  31.07 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  29.2 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.68 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  26.44 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.15 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  23.12 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.12 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.1 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  31.74 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>