More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1532 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 483 aa  1006    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  42.29 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  41.49 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  37.61 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  36.32 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  36.47 
 
 		 457 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 448 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  31.74 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 		 447 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 		 445 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  32.36 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 462 aa  190  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 501 aa  176  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 458 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  25.91 
 
 		 449 aa  143  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  34.08 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 428 aa  140  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  35.4 
 
 		 484 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 428 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 		 471 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  34.08 
 
 		 447 aa  136  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  33.11 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  33.08 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 		 435 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  24.41 
 
 		 477 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  27.9 
 
 		 444 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 		 444 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  27.73 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  25.51 
 
 		 469 aa  99.8  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  24.45 
 
 		 458 aa  93.6  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 468 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 359 aa  90.9  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  36.88 
 
 		 355 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  36.25 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  24.69 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  33.13 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  29 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.89 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.97 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  28.64 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  23.49 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1216  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 382 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.73 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  28.92 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  31.22 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  30.24 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  31.55 
 
 		 344 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  31.22 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.29 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  30.24 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>