More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4556 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 490 aa  1025    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  68.84 
 
 		 499 aa  713    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  55.44 
 
 		 481 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  51.87 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  51.54 
 
 		 483 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  49.59 
 
 		 484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  50.93 
 
 		 487 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  50.31 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  43.09 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  41.12 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  40.92 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  39.47 
 
 		 444 aa  320  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  36.72 
 
 		 435 aa  269  8.999999999999999e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  34 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 459 aa  209  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  35.31 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 448 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 434 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  31.26 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  35.69 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  32.63 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 428 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  33.11 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  33.45 
 
 		 423 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 		 421 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.74 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  34.11 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 480 aa  116  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 485 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 501 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 		 428 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  28.22 
 
 		 450 aa  94.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 403 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  30.59 
 
 		 366 aa  87.4  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 377 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 349 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 518 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  23.79 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  25.85 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 381 aa  67  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.37 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 345 aa  67  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 344 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  28.57 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  23.13 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  31.84 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>