More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1780 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 360 aa  746    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  37.85 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  37.02 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.62 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  36.26 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  32.27 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 		 364 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  34.51 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.67 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  33.97 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 354 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  33.7 
 
 		 347 aa  165  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  33.7 
 
 		 351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  33.7 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  33.7 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  33.7 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  33.7 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  32.7 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  32.7 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.72 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.77 
 
 		 362 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 		 357 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  29.83 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  29.83 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1660  oxidoreductase domain-containing protein  25.28 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0430  oxidoreductase-like  29.68 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1256  oxidoreductase domain-containing protein  26.23 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3288  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  33.99 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.2 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  35.5 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.32 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  33 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  29.08 
 
 		 404 aa  99.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 		 412 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  32.32 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 365 aa  95.9  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  33 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 		 348 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 		 355 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  25.88 
 
 		 337 aa  92.8  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4840  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  32.29 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1888  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.854588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  34.98 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  37.41 
 
 		 340 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2174  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193543  decreased coverage  0.00937505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 432 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  30.35 
 
 		 395 aa  89.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 348 aa  89.7  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.07 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  31.63 
 
 		 348 aa  89.4  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 		 338 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.52 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  26.07 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.52 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>