More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0817 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  71.31 
 
 		 473 aa  706    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  65.3 
 
 		 484 aa  677    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 481 aa  1000    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  62.73 
 
 		 487 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  58.23 
 
 		 499 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  55.44 
 
 		 490 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  52.39 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  52.17 
 
 		 476 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  43.22 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  39.38 
 
 		 447 aa  323  6e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  38.9 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  42.02 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  33.4 
 
 		 435 aa  246  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 468 aa  223  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  37.23 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  36.3 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  27.86 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  36.97 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 		 436 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  34.44 
 
 		 462 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  35.66 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 		 421 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 		 435 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.29 
 
 		 434 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  35.11 
 
 		 449 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  33.05 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  35.09 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  33.08 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 		 462 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  34.53 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  28.32 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 452 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 428 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  34.6 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 		 477 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 501 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  30.34 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  32.71 
 
 		 428 aa  97.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 403 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 		 441 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 		 359 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  27.81 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  23.06 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.2 
 
 		 310 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  32.19 
 
 		 310 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 		 355 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 		 342 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.67 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  23.26 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  24.47 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>