More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6207 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
476 aa  998    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  68.55 
 
 
483 aa  691    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  54.04 
 
 
484 aa  505  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  51.77 
 
 
473 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  52.17 
 
 
481 aa  484  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  52.16 
 
 
499 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  51.14 
 
 
487 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  50.31 
 
 
490 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  42.86 
 
 
444 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  42.21 
 
 
444 aa  350  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  40.79 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  37.32 
 
 
447 aa  297  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  38.74 
 
 
435 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  33.26 
 
 
468 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  31.95 
 
 
459 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
448 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  33.22 
 
 
437 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  26.93 
 
 
436 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  34.25 
 
 
440 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
457 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 
448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
435 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  33.56 
 
 
439 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 
451 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  34.16 
 
 
424 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
427 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  33.67 
 
 
421 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
471 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  33.11 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 
435 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 
447 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 
476 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
428 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  31.22 
 
 
480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 
451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
478 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  31.32 
 
 
436 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
458 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
501 aa  113  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 
462 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
451 aa  110  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 
485 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 
428 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
477 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  30.3 
 
 
450 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 
460 aa  93.2  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
458 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 
406 aa  86.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  28.94 
 
 
463 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  32.1 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 
359 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.54 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
320 aa  67  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 
352 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
368 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  31.67 
 
 
342 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.09 
 
 
356 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 
403 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.51 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 
337 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 
389 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 
358 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 
456 aa  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
334 aa  63.9  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.34 
 
 
353 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  22.62 
 
 
359 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>