More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2975 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 424 aa  883    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  71.43 
 
 		 421 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  79.38 
 
 		 423 aa  714    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  34.08 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  31.28 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  29.57 
 
 		 471 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  29.98 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  29.65 
 
 		 449 aa  169  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  38.11 
 
 		 484 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 477 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 435 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 		 462 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  36.3 
 
 		 481 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  24.25 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 		 483 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  35.82 
 
 		 476 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 		 487 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 448 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 		 434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  34.16 
 
 		 476 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  36.19 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  33.11 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 		 499 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 444 aa  113  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 460 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  24.27 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  23.26 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  24.95 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  31.05 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 447 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 462 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 452 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 		 480 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.09 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  29.94 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  23.59 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  33.83 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.62 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  33.52 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.84 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  23.24 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.84 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  24.87 
 
 		 336 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  33.11 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  32.84 
 
 		 287 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  32.09 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>