More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7903 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 390 aa  795    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  58.21 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  56.19 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  55.87 
 
 		 393 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  50.26 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  51.65 
 
 		 699 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  53.23 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  48.75 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  48.21 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  53.82 
 
 		 405 aa  319  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7455  hypothetical protein  69.86 
 
 		 227 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  28.13 
 
 		 455 aa  116  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  27.71 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  35.75 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  29.78 
 
 		 429 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  35.02 
 
 		 493 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 		 421 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 496 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  32.33 
 
 		 495 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 425 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  29.94 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  25.2 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  23.78 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 		 345 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  26.08 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  26.65 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  25.2 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 		 715 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 329 aa  94  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 		 350 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 		 376 aa  90.9  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  36.2 
 
 		 474 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 359 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 350 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 359 aa  89.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.79 
 
 		 335 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  32.7 
 
 		 350 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  26.4 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  27.12 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 		 431 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  31.09 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  22.61 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.36 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.65 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  33.15 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  29.84 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.65 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  32.2 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.68 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 452 aa  82.8  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  29.81 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  33.49 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  30.45 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  21.82 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  23.2 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  28.28 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  32.29 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  33.17 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.42 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  32.95 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  30.15 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>