More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4012 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 480 aa  995    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  47.45 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  39.54 
 
 		 457 aa  312  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  42.67 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  39.31 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  37.42 
 
 		 445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  38.95 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 		 435 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  36.97 
 
 		 483 aa  240  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  34.5 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  33.41 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 501 aa  179  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 427 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 481 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 428 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  26.14 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  23.86 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 		 477 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 		 490 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 462 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  29.4 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  25.78 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 		 471 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 499 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 485 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 		 403 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 435 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  24.35 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  25.33 
 
 		 444 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  23.42 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  31.93 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.58 
 
 		 349 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.43 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  26.08 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  29.65 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.16 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.82 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0037  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.83 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  23.3 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.89 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 337 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.83 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  23.09 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  35.67 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 359 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.24 
 
 		 359 aa  73.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>