More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4489 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 457 aa  949    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  70 
 
 		 451 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  53.9 
 
 		 448 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  53.93 
 
 		 440 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  48.24 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  45.62 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  42.63 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  39.54 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  36.47 
 
 		 483 aa  249  9e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 		 448 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 501 aa  219  7e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 435 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 434 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  28.6 
 
 		 476 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 462 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 		 439 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 477 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 478 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 444 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 459 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  24.4 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 		 487 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  25.05 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  24.45 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  24.94 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  23.09 
 
 		 441 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 432 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  28.2 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 468 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 447 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  22.25 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  21.24 
 
 		 458 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  21.69 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.77 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  22.55 
 
 		 421 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 359 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 		 452 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 359 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.71 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  21.89 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.69 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  29.28 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  29.28 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.49 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  23.06 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.45 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1606  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.687359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.22 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  22.8 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>