More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1207 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 435 aa  915    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2873  oxidoreductase domain protein  52.54 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000305709  normal  0.0375286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1606  oxidoreductase domain protein  49.06 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.687359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  41.28 
 
 		 445 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  41.61 
 
 		 447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0037  oxidoreductase domain protein  41.5 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  39.55 
 
 		 452 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1134  oxidoreductase domain protein  41.42 
 
 		 442 aa  305  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1216  oxidoreductase domain protein  35.85 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0111  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.480309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  34.78 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 403 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  22.49 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  23.06 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  22.2 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  22.61 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  21.98 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  24.92 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 483 aa  67  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  23.37 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  22.11 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  22.06 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  27.59 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  21.35 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.68 
 
 		 336 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.58 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  20.89 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  23.75 
 
 		 330 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  25.56 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  23.55 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  29.05 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  24.09 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  22.31 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.13 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  28.07 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  24.17 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  23.3 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1026  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  26.12 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02378  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09900)  22.37 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0984542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  20.5 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  27.91 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  21.08 
 
 		 451 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 		 337 aa  57  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  22.65 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  28.12 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  21.82 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  23.47 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.79 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  20.24 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  23.78 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.17 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  23.26 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4113  oxidoreductase domain-containing protein  25.11 
 
 		 354 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  27.91 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  27.78 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  25.37 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  23.35 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  21.43 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  21.43 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  23.9 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  23.33 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  24.23 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  23.38 
 
 		 347 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  26.59 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  28.48 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  31.73 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>