More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0790 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
467 aa  912    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  58.7 
 
 
474 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  56.47 
 
 
493 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  55.18 
 
 
470 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  55.28 
 
 
495 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  54.8 
 
 
500 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  55.38 
 
 
450 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  49.56 
 
 
452 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  47.87 
 
 
435 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  46.54 
 
 
444 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  42.53 
 
 
431 aa  359  7e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  42.08 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  43.97 
 
 
455 aa  344  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  43.18 
 
 
427 aa  342  5.999999999999999e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  42.11 
 
 
496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  47.84 
 
 
411 aa  305  9.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  39.56 
 
 
442 aa  286  5.999999999999999e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  37.39 
 
 
429 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  36.57 
 
 
421 aa  267  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  35.32 
 
 
425 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 
425 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  35.54 
 
 
427 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  30.51 
 
 
390 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
405 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 
699 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  31.92 
 
 
390 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 
396 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  21.79 
 
 
416 aa  90.1  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 
414 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 
399 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 
421 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
335 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  27.76 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  33.92 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  27.59 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  30.46 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  24.7 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 
390 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  35.44 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  25.33 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  25.33 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  38.82 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  23.63 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  35.23 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2433  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  31.11 
 
 
355 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.8 
 
 
347 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 
342 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  32.89 
 
 
330 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 
680 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  36 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
734 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  31.37 
 
 
715 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 
361 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  30.43 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  27.04 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  22.39 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  24.29 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 
355 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
369 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  23.01 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 
355 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>