More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2126 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
397 aa  775    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  64.49 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  52.81 
 
 
390 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  53.51 
 
 
399 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  52.13 
 
 
393 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  50.77 
 
 
699 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  49.06 
 
 
403 aa  352  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  54.66 
 
 
405 aa  352  8e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  48.75 
 
 
390 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  46.68 
 
 
390 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 
386 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7455  hypothetical protein  54.95 
 
 
227 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
385 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
385 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 
429 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
425 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  26.9 
 
 
393 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  30.42 
 
 
444 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
425 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  27.3 
 
 
455 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
442 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 
496 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 
435 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  31.6 
 
 
474 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 
380 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
495 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 
467 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  35.56 
 
 
493 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  22.25 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  27.17 
 
 
347 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  22.25 
 
 
421 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  26.86 
 
 
421 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
431 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  23.61 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  24.3 
 
 
403 aa  87  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29 
 
 
350 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  35.48 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  25.87 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  23.31 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  22.3 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  25.62 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  37.01 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31.63 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  22.69 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  29.35 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  25.14 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  27.86 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  31.76 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  26.63 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 
368 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  34.67 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  27.86 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  25.86 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  35 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  27.5 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.27 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  22.63 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  36.08 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 
340 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  39.26 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.16 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>