40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7455 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7455  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  69.86 
 
 
390 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  50 
 
 
390 aa  138  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  60 
 
 
699 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  53.72 
 
 
393 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  50.34 
 
 
390 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  51.72 
 
 
403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  51.91 
 
 
396 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  54.95 
 
 
399 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  54.95 
 
 
397 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  54.29 
 
 
405 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  34.78 
 
 
444 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  34.93 
 
 
495 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  35.11 
 
 
470 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
452 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 
442 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  34.51 
 
 
421 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  28.03 
 
 
455 aa  55.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  35.37 
 
 
435 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  31.58 
 
 
427 aa  53.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 
431 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 
431 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  31.01 
 
 
496 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  33.65 
 
 
429 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  33.91 
 
 
493 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
500 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 
425 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  32.5 
 
 
474 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  31.73 
 
 
425 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 
351 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  32.94 
 
 
411 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 
427 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 
385 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  27.84 
 
 
450 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
385 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 
421 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 
467 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  36.59 
 
 
421 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  36.59 
 
 
421 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  25.45 
 
 
393 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>