More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05520 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 493 aa  984    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  64.55 
 
 		 500 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  62.63 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  61.77 
 
 		 470 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  56.77 
 
 		 450 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  53.04 
 
 		 474 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  55.99 
 
 		 467 aa  430  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  46.54 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  47.21 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  41.43 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  40.82 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  43.07 
 
 		 455 aa  353  4e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  44.66 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  42.64 
 
 		 427 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  39.06 
 
 		 496 aa  316  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  45.49 
 
 		 411 aa  299  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  37.95 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 		 425 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  34.99 
 
 		 425 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  35.78 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  34.57 
 
 		 421 aa  253  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  32.18 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  29.92 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  35.02 
 
 		 390 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  32.34 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  25.21 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 		 396 aa  98.2  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  23.96 
 
 		 385 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 397 aa  96.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  36.84 
 
 		 405 aa  91.3  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 		 699 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 342 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 403 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  31.05 
 
 		 380 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  22.95 
 
 		 393 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 		 337 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  27.21 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 		 468 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.52 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 330 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  24.94 
 
 		 399 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  29.52 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  28.3 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  22.75 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.4 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  25.22 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.13 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  26.36 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.79 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  23.61 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  26.21 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  31.33 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  28.39 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.78 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 		 359 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  22.61 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  24.24 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 463 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  24.24 
 
 		 366 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 341 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  32.61 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  27.85 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23 
 
 		 359 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  28.43 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  27.85 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  26.53 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  31.25 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>