More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2033 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  81.73 
 
 		 444 aa  707    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 435 aa  882    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  59.59 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  48.3 
 
 		 455 aa  435  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  48.72 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  48.49 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  54.04 
 
 		 411 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  48.37 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  49.21 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  48.05 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  48.74 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  46.54 
 
 		 493 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  46.58 
 
 		 467 aa  353  5e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  47.84 
 
 		 450 aa  346  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  47.33 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  45.37 
 
 		 496 aa  332  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  43.08 
 
 		 442 aa  296  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  38.72 
 
 		 425 aa  259  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  40.46 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  38.9 
 
 		 421 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  38.24 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  33.97 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 		 699 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  28.77 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  29.92 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 397 aa  100  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  39.74 
 
 		 405 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 385 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  22.93 
 
 		 403 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  27.55 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  24.4 
 
 		 386 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 715 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  33.01 
 
 		 359 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  24.77 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 		 366 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  26.09 
 
 		 393 aa  87  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  33 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  20.86 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  28.71 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  27.67 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  27.67 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  23.21 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.89 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  31.71 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  32.32 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  33.33 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.42 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  29.35 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  29.77 
 
 		 354 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  35.71 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  23.87 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.674372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  31.51 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  24.09 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 665 aa  73.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  28 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  25.23 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  34.56 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>