More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3364 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  100 
 
 		 368 aa  762    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.674372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2759  putative oxidoreductase  63.66 
 
 		 373 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0161834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1939  oxidoreductase-like  63.09 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  49.73 
 
 		 380 aa  362  8e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  35.47 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  35.73 
 
 		 404 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  35.2 
 
 		 377 aa  215  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  22.01 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  29.8 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  27.8 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1850  inositol 2-dehydrogenase  29.46 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  26.92 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.71 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  27.39 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  25.47 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  26.72 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  26.29 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  24.75 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  23.91 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  23.08 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.8 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  28.98 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  35.29 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.32 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  27.03 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.6 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  27.03 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  27.03 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  27.03 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  27.03 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  26.34 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  22.63 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  26.14 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  22.98 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  28.03 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  29.84 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.1 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  29.77 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  23.64 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  27.51 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  23.06 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  22.78 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  22.71 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2259  MviM protein  29.29 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127425  hitchhiker  0.00202503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  23.91 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  23.65 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  23.65 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.08 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  23.65 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  24.8 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  23.26 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  25.31 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  22.39 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  27.65 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  22.59 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.22 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  23.08 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  35.19 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  27.1 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  24.75 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  20.21 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  26.64 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.76 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  26.41 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  26.3 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  22.83 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>