More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1950 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  779    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  49.73 
 
 		 368 aa  362  8e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.674372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1939  oxidoreductase-like  52.6 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2759  putative oxidoreductase  50.41 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0161834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  36 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  34.74 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  36.17 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  26.17 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.86 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  25.49 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  25.49 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.49 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  26.4 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  25 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.53 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.53 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  29.34 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  25.82 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 330 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  25.9 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  31.62 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  31.05 
 
 		 493 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  32.6 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1331  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.13 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  33.86 
 
 		 347 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 350 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  28.24 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  23.5 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  24.53 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  25.34 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.04 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  25.89 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  23.25 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  24.73 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  22.9 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  31.67 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  32.63 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  28.4 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  33.84 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  28.61 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  26.51 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.41 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  27.35 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  23.29 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  24.86 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  26.92 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  22.94 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  31.58 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  22.44 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  25.14 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  26.32 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.32 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  26.32 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  26.32 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  26.32 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  26.32 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  28.24 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  24.71 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  31.87 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  24.73 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  26.32 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 470 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  26.43 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.89 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  25.68 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  23.56 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  28.99 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  31.22 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  27.31 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  31.08 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>