More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1027 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  93.35 
 
 
377 aa  740    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
404 aa  841    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  60.88 
 
 
403 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3364  oxidoreductase-like  35.73 
 
 
368 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.674372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  36 
 
 
380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1939  oxidoreductase-like  36.36 
 
 
361 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2759  putative oxidoreductase  32.78 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0161834 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 
385 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  23.69 
 
 
444 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  27.07 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
425 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  25.97 
 
 
347 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 
425 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  24.71 
 
 
429 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  22.57 
 
 
455 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  29.36 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  25.84 
 
 
390 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 
332 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  24.77 
 
 
435 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
344 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 
339 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
329 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 
470 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
328 aa  87.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  23.61 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 
390 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  28.84 
 
 
335 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  27.37 
 
 
450 aa  86.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 
330 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  29.69 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  26.32 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.52 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  21.79 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  30.15 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  25.42 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  28.22 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  30.15 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  30.15 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
353 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.15 
 
 
345 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  27.8 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  30.15 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  30.15 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  23.18 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  25.33 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.48 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.33 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 
463 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  23.78 
 
 
337 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04890  conserved hypothetical protein  23.82 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.07 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  24.53 
 
 
337 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  29.89 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  22.69 
 
 
421 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  29.35 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.81 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.28 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  28.2 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.28 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.93 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.28 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  24.1 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  27.14 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  22.6 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  24.09 
 
 
496 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.27 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  24.35 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  24.1 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  23.69 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  26.67 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  26.22 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.53 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  24.75 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  23.69 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>