More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5530 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 411 aa  824    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  57.34 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  54.55 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  54.04 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  50.83 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  50.12 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  49.06 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  45.87 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  48.65 
 
 		 474 aa  346  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  44.68 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  43.02 
 
 		 495 aa  329  6e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  45.49 
 
 		 493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  42.14 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  44.7 
 
 		 450 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  47.5 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  40.32 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  42.44 
 
 		 500 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  38.95 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  40.43 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  38.72 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  38.8 
 
 		 421 aa  259  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  37.29 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  32.17 
 
 		 699 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  28.37 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  27.76 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  23.13 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.28 
 
 		 342 aa  89.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  24.53 
 
 		 393 aa  87  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  22.92 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  36.42 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  31.28 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  22.73 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  21.51 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  21.76 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  31.55 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  22.33 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  21.51 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 341 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  34.34 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  23.12 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  30.1 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  30.96 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.34 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  31.07 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  33.78 
 
 		 665 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 		 326 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.91 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  35.05 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.04 
 
 		 670 aa  69.7  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  24.42 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 734 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  36.76 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  34.27 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  23.08 
 
 		 373 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2924  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  26.21 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.19 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  30.58 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 699 aa  66.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>