More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4070 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  48.62 
 
 		 713 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  48.55 
 
 		 712 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 734 aa  1493    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  47.9 
 
 		 722 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  49.11 
 
 		 699 aa  678    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  44.38 
 
 		 721 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 719 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 		 719 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  41.15 
 
 		 715 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 		 724 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  38.05 
 
 		 715 aa  439  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2162  oxidoreductase domain-containing protein  35.32 
 
 		 798 aa  345  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1306  oxidoreductase-like  33.99 
 
 		 747 aa  340  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.18 
 
 		 335 aa  121  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  33.06 
 
 		 353 aa  105  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 371 aa  100  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 387 aa  97.8  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  29.76 
 
 		 336 aa  97.8  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4072  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 		 365 aa  97.8  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 334 aa  97.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 371 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 		 329 aa  95.5  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  27.61 
 
 		 360 aa  93.6  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 		 363 aa  93.2  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.77 
 
 		 343 aa  92  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 320 aa  92  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 362 aa  91.3  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 		 360 aa  91.3  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.67 
 
 		 360 aa  91.3  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 		 359 aa  90.9  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.81 
 
 		 341 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  26.09 
 
 		 347 aa  90.1  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.88 
 
 		 331 aa  90.5  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 375 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  27.57 
 
 		 341 aa  89  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  28.85 
 
 		 341 aa  89  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.57 
 
 		 341 aa  89  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  27.57 
 
 		 341 aa  89  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  33.05 
 
 		 387 aa  89  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  29.47 
 
 		 287 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.11 
 
 		 386 aa  88.2  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 667 aa  87.8  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 385 aa  88.2  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.25 
 
 		 369 aa  87.8  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.72 
 
 		 326 aa  87  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 356 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1754  oxidoreductase domain-containing protein  31.99 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0879684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  33.67 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  35.12 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 347 aa  84  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 377 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 391 aa  83.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 358 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.48 
 
 		 342 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  23.3 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 384 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.22 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1762  oxidoreductase domain-containing protein  32.49 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  31.68 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  37.75 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 		 320 aa  80.1  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 377 aa  80.1  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.8 
 
 		 329 aa  80.1  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 355 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 		 376 aa  80.1  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  29.13 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 		 345 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  27.8 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  26.41 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.66 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>