More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23420 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  72.33 
 
 		 712 aa  1087    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  68.86 
 
 		 713 aa  1024    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  47.9 
 
 		 734 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  53.75 
 
 		 721 aa  767    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  100 
 
 		 722 aa  1487    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 		 719 aa  598  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  44.37 
 
 		 699 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.22 
 
 		 719 aa  561  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  38.37 
 
 		 715 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  40.45 
 
 		 715 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 		 724 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2162  oxidoreductase domain-containing protein  37.53 
 
 		 798 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1306  oxidoreductase-like  37.95 
 
 		 747 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.38 
 
 		 343 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.24 
 
 		 356 aa  96.3  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5213  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.66 
 
 		 354 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000291101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4072  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 365 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.37 
 
 		 336 aa  90.1  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.27 
 
 		 373 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 		 344 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.13 
 
 		 373 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 		 373 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.73 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.67 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.33 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.38 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 		 344 aa  83.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  26.73 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.73 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  26.73 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  26.73 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  26.73 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  26.73 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  23.91 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  26.43 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  26.11 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  26.73 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  26.4 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.97 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 328 aa  80.5  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  26.47 
 
 		 373 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.37 
 
 		 357 aa  80.5  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  28.44 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  25.87 
 
 		 346 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  23.7 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  40.13 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  28.42 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  26.64 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.28 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.57 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.46 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.89 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.68 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.94 
 
 		 330 aa  77  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.23 
 
 		 341 aa  77  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.16 
 
 		 342 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.26 
 
 		 329 aa  77  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  26.89 
 
 		 334 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  26.06 
 
 		 362 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  27.62 
 
 		 336 aa  77  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  25.78 
 
 		 373 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 334 aa  76.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  26.06 
 
 		 362 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  24.92 
 
 		 342 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.57 
 
 		 341 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 337 aa  76.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 		 342 aa  76.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.9 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  27.09 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  25.69 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  25.7 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  27.8 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  26.58 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0154  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.22 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.25 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  26.77 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  26.82 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.61 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  26.82 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.57 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  25.68 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.96 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>