More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0552 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  100 
 
 		 362 aa  736    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  98.34 
 
 		 362 aa  726    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  86.74 
 
 		 363 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  99.17 
 
 		 362 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  88.64 
 
 		 363 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  84.96 
 
 		 360 aa  624  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  78.03 
 
 		 365 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  78.19 
 
 		 354 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  78.47 
 
 		 354 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  78.19 
 
 		 354 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  77.78 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  78.06 
 
 		 354 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  78.39 
 
 		 364 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  61.36 
 
 		 355 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  61.19 
 
 		 353 aa  431  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.88 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.88 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  46.88 
 
 		 350 aa  311  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  46.88 
 
 		 350 aa  311  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.88 
 
 		 350 aa  311  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.88 
 
 		 350 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.59 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  46.59 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.59 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  44 
 
 		 350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.33 
 
 		 350 aa  281  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  42.45 
 
 		 352 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  42.9 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.74 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  41.74 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  41.57 
 
 		 373 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.46 
 
 		 373 aa  271  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.34 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.05 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  40.9 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  42.45 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  40.9 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.48 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  41.03 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  41.41 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 		 350 aa  245  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  40 
 
 		 349 aa  242  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  40 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.72 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.15 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  37.96 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.42 
 
 		 357 aa  225  9e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  35.49 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.98 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.434256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2069  alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.48 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.69 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2380  alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 		 357 aa  212  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  37.05 
 
 		 360 aa  212  9e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  37.18 
 
 		 369 aa  209  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.49 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.89 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 		 358 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 		 357 aa  199  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  34.47 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  34.32 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.99 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.47 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.47 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.71 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.2 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.2 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  34.2 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  32.87 
 
 		 340 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  33.91 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.29 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  33.91 
 
 		 347 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  33.91 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.14 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  33.91 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.84 
 
 		 343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>