More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2162 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2162  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 798 aa  1542    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1306  oxidoreductase-like  75.77 
 
 		 747 aa  961    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 		 719 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  39.31 
 
 		 713 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  36.38 
 
 		 721 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  39.34 
 
 		 724 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  37.94 
 
 		 722 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  36.43 
 
 		 712 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  38.85 
 
 		 719 aa  425  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  38.81 
 
 		 715 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  35.54 
 
 		 734 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  35.16 
 
 		 699 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  33.84 
 
 		 715 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4072  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 		 365 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 		 346 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5213  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.16 
 
 		 354 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000291101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.64 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  31.6 
 
 		 336 aa  84  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 334 aa  83.2  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.32 
 
 		 329 aa  80.5  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  40.94 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  35.42 
 
 		 353 aa  80.1  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  33.1 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  28.23 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  27.21 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  32.84 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  34.59 
 
 		 384 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.12 
 
 		 343 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  31.58 
 
 		 360 aa  77  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.43 
 
 		 359 aa  77.4  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  34.59 
 
 		 384 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  39.45 
 
 		 332 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  33.09 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 355 aa  76.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  32.77 
 
 		 342 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 320 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  34.11 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  33.91 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  29.22 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.4 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  39.42 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  26.17 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 394 aa  73.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  28.52 
 
 		 333 aa  73.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 356 aa  73.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 383 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 333 aa  73.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  34.75 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  35.51 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  34.41 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  34.75 
 
 		 405 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  35.03 
 
 		 382 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 335 aa  72  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 330 aa  72  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 		 337 aa  72  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  39.02 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  42.57 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  35.71 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3886  alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  38.62 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  34.25 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  37.93 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  32.88 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 667 aa  70.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.9 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  34.01 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.96 
 
 		 384 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 338 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  28.25 
 
 		 329 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 331 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 327 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  38.83 
 
 		 371 aa  70.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  31.71 
 
 		 335 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 396 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 332 aa  70.5  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  33.6 
 
 		 322 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 370 aa  70.5  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 337 aa  69.7  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.16 
 
 		 384 aa  70.1  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  28.26 
 
 		 314 aa  69.7  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  39.55 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  33.83 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  28.06 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>