More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1306 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2162  oxidoreductase domain-containing protein  75.77 
 
 		 798 aa  990    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1306  oxidoreductase-like  100 
 
 		 747 aa  1440    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 		 719 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 		 724 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  38.44 
 
 		 713 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  36.18 
 
 		 721 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  37.95 
 
 		 722 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 		 712 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  39.75 
 
 		 719 aa  428  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  38.68 
 
 		 715 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 		 734 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  34.99 
 
 		 699 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 		 715 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4072  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.52 
 
 		 357 aa  88.2  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  35.33 
 
 		 337 aa  87.8  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.91 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  31.61 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.91 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.53 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.92 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.51 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  35.26 
 
 		 325 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 360 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  31.88 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  33.71 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  32.8 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  33.96 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  33.98 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  32.33 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 337 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5213  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.65 
 
 		 354 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000291101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  35.9 
 
 		 323 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 344 aa  77  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 334 aa  77  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.88 
 
 		 335 aa  77  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  37.4 
 
 		 327 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  37.01 
 
 		 371 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.61 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  28.06 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  27.14 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  33.56 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  31.17 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  40.38 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  23.47 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  28.41 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 358 aa  73.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 		 326 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1364  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 330 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 		 345 aa  73.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  35.15 
 
 		 382 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 		 667 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  30.37 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  33.03 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 395 aa  72  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 325 aa  72  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  31.69 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  34.76 
 
 		 333 aa  72  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.87 
 
 		 428 aa  72  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  28.52 
 
 		 317 aa  72  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  30.22 
 
 		 319 aa  72  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  52.63 
 
 		 336 aa  72  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 		 320 aa  72  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 329 aa  72  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  34.25 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  37.41 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  45 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.75 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  37.68 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  41.3 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.73 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  36.89 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 1079 aa  71.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>