More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02345 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1456    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  52.62 
 
 		 721 aa  755    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  68.86 
 
 		 722 aa  1024    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  48.62 
 
 		 734 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  68.11 
 
 		 712 aa  1032    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  47.34 
 
 		 719 aa  615  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  43.74 
 
 		 699 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.89 
 
 		 719 aa  551  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  39.72 
 
 		 715 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  39.47 
 
 		 724 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  41.44 
 
 		 715 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2162  oxidoreductase domain-containing protein  39.5 
 
 		 798 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1306  oxidoreductase-like  38.44 
 
 		 747 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.08 
 
 		 343 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 		 356 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.93 
 
 		 341 aa  92.8  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5213  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.57 
 
 		 354 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000291101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.05 
 
 		 341 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4072  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 		 365 aa  90.9  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  28.93 
 
 		 287 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  28.51 
 
 		 341 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  29.13 
 
 		 341 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  28.51 
 
 		 341 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 341 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 341 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 341 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 341 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 341 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  33.05 
 
 		 341 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 341 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 341 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  30.47 
 
 		 322 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 346 aa  87  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  27.52 
 
 		 373 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 337 aa  87  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.43 
 
 		 346 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 		 318 aa  86.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  24.38 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  24.38 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.55 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  29.06 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0075  sorbitol dehydrogenase, putative  28.75 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.44 
 
 		 373 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  26.37 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0154  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.94 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.17 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.34 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.38 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.86 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.35 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.43 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  25.72 
 
 		 347 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 325 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.27 
 
 		 341 aa  80.5  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.84 
 
 		 354 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 334 aa  80.5  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  25.84 
 
 		 365 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  25.72 
 
 		 347 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.72 
 
 		 347 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  25.72 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  28.96 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  25.72 
 
 		 347 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  25.84 
 
 		 354 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  25.72 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  25.72 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  23.73 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  27.02 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.89 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.36 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  26.01 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  26.13 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.71 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  28.94 
 
 		 344 aa  77  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.01 
 
 		 357 aa  77  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.68 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.52 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  28.15 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.29 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.3 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  23.62 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  31.61 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>