More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4416 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  92.55 
 
 		 364 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  94.63 
 
 		 354 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  94.35 
 
 		 354 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  94.35 
 
 		 354 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  99.44 
 
 		 354 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  94.35 
 
 		 365 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  79.77 
 
 		 360 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  79.2 
 
 		 363 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  79.2 
 
 		 363 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  78.63 
 
 		 362 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  78.35 
 
 		 362 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  78.06 
 
 		 362 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  63.07 
 
 		 355 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  61.47 
 
 		 353 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.59 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.59 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  46.31 
 
 		 350 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  46.31 
 
 		 350 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.31 
 
 		 350 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  46.59 
 
 		 350 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.31 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.02 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  46.02 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  45.3 
 
 		 350 aa  299  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  44.07 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.33 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 		 350 aa  285  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.89 
 
 		 350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.97 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  41.81 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 		 373 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  41.81 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.13 
 
 		 373 aa  272  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  39.83 
 
 		 352 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.89 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 		 351 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  42.9 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  41.24 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 349 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  39.55 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  40.74 
 
 		 350 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  39.55 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  39.03 
 
 		 349 aa  239  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.11 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.7 
 
 		 343 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 343 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.7 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.98 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2069  alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  36.83 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  37.68 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2380  alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 354 aa  215  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.55 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.434256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  34.08 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  36.36 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.52 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.93 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.47 
 
 		 343 aa  205  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.08 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  35.47 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.87 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  35.8 
 
 		 340 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.11 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.56 
 
 		 347 aa  202  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89701  polyol dehydrogenase  34.46 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  34.85 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  36.2 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.2 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  36.2 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  36.2 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 		 347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  36.2 
 
 		 347 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  35.91 
 
 		 347 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.39 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.63 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.39 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>