More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3331 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
719 aa  1443    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  46.74 
 
 
721 aa  625  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
712 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  47.34 
 
 
713 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  44.68 
 
 
722 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 
719 aa  560  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  40.68 
 
 
734 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  40.96 
 
 
724 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  42.43 
 
 
715 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  41.12 
 
 
699 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  38.83 
 
 
715 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2162  oxidoreductase domain-containing protein  38.82 
 
 
798 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1306  oxidoreductase-like  39.75 
 
 
747 aa  372  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.26 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.63 
 
 
335 aa  87.4  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.47 
 
 
343 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3886  alcohol dehydrogenase  29.26 
 
 
330 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025285  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4072  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
365 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.13 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  28.07 
 
 
389 aa  82  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  24.57 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0075  sorbitol dehydrogenase, putative  28.32 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  29.19 
 
 
341 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  29.19 
 
 
341 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
342 aa  79  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.71 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.71 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  26.21 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
341 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
341 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5213  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.25 
 
 
354 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000291101  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
341 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
341 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
341 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  32.05 
 
 
341 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
341 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
341 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.48 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  24.86 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.29 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  28.23 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  28.01 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3512  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.66 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.15 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.92 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  27.55 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  28.23 
 
 
341 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  25.21 
 
 
340 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.76 
 
 
373 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  27.25 
 
 
330 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.42 
 
 
357 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3193  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
321 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  28.09 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04336  L-arabinitol 4-dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_1G11020)  27.39 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  27.65 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3501  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.3 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3286  quinone oxidoreductase  27.3 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.635243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  27.17 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3544  quinone oxidoreductase  27.3 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.752673  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  25.56 
 
 
1005 aa  71.6  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  25.16 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  27.63 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
328 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.3 
 
 
325 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
344 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3256  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.3 
 
 
321 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  25.83 
 
 
316 aa  70.1  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
350 aa  70.1  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  25.11 
 
 
362 aa  70.1  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 
373 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 
359 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.78 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3200  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.3 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  25.46 
 
 
316 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  27.42 
 
 
330 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  29.59 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  23.93 
 
 
334 aa  69.3  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0154  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.87 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  25.51 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  25.4 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.36 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>