More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0849 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
344 aa  697    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  80.41 
 
 
347 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  80.12 
 
 
347 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  68.24 
 
 
348 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  66.08 
 
 
348 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2163  alcohol dehydrogenase  70.18 
 
 
345 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.47 
 
 
348 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.12 
 
 
346 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0551  D-xylulose reductase  68.6 
 
 
347 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  65.5 
 
 
346 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  65.6 
 
 
347 aa  444  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6662  alcohol dehydrogenase  61.4 
 
 
344 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838814  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1176  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  61.11 
 
 
344 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136787  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  60.23 
 
 
350 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3068  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.99 
 
 
344 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5063  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.7 
 
 
344 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392538  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4382  alcohol dehydrogenase  61.7 
 
 
344 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5797  alcohol dehydrogenase  61.7 
 
 
344 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202299  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1653  putative D-xylulose reductase  59.06 
 
 
344 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1076  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  59.06 
 
 
344 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  59.06 
 
 
344 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1235  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  59.06 
 
 
344 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0351  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  59.06 
 
 
344 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773676  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0068  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  59.06 
 
 
344 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493904  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1742  D-xylulose reductase  58.77 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.247806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.6 
 
 
347 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  55.85 
 
 
343 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1700  threonine dehydrogenase  55.85 
 
 
346 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.333284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  53.51 
 
 
344 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.52 
 
 
359 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.19 
 
 
346 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  39.65 
 
 
348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.35 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  38.39 
 
 
359 aa  242  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.57 
 
 
342 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.42 
 
 
352 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.11 
 
 
344 aa  227  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  37.98 
 
 
342 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  37.75 
 
 
363 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  37.27 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.8 
 
 
352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  37.27 
 
 
392 aa  211  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  36.45 
 
 
583 aa  209  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  38.11 
 
 
347 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  36.53 
 
 
400 aa  207  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  37.84 
 
 
347 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.84 
 
 
347 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  37.84 
 
 
347 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  37.84 
 
 
347 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  37.84 
 
 
347 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  37.54 
 
 
347 aa  206  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  37.54 
 
 
347 aa  206  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.51 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.11 
 
 
347 aa  199  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.51 
 
 
345 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00942  hypothetical protein similar to L-arabitol dehydrogenase (Eurofung)  32.08 
 
 
386 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.96 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
345 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
341 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  35.31 
 
 
379 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  35.84 
 
 
343 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.76 
 
 
341 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
341 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.42 
 
 
351 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  36.12 
 
 
373 aa  186  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  36.23 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.05 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.67 
 
 
352 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 
352 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 
343 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.35 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.71 
 
 
343 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
347 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.89 
 
 
343 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.15 
 
 
360 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.02 
 
 
345 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  31.44 
 
 
375 aa  171  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
345 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04336  L-arabinitol 4-dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_1G11020)  32.94 
 
 
427 aa  169  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
373 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.31 
 
 
373 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.93 
 
 
344 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
373 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.72 
 
 
373 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.73 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08552  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01490)  36 
 
 
363 aa  166  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  30.59 
 
 
416 aa  162  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5213  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.55 
 
 
354 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000291101  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  35.06 
 
 
347 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  30.55 
 
 
343 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00774  zinc-dependent alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14390)  31.44 
 
 
400 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
345 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40172  Sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  29.61 
 
 
381 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.859827  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  31.82 
 
 
363 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>