More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1998 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  100 
 
 
347 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  99.42 
 
 
347 aa  709    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  99.42 
 
 
347 aa  709    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  92.51 
 
 
347 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  98.56 
 
 
347 aa  705    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  98.85 
 
 
347 aa  705    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  99.42 
 
 
347 aa  709    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  99.71 
 
 
347 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  77.81 
 
 
347 aa  569  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.3 
 
 
346 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  43.3 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.48 
 
 
347 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.57 
 
 
359 aa  240  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.86 
 
 
344 aa  229  7e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.12 
 
 
342 aa  222  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  39.81 
 
 
343 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109123  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.66 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  38.57 
 
 
347 aa  212  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  36.6 
 
 
400 aa  212  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
348 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 
344 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  39.09 
 
 
350 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.5 
 
 
347 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
348 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  37.46 
 
 
392 aa  207  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.84 
 
 
347 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.99 
 
 
346 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  37.84 
 
 
344 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  36.86 
 
 
392 aa  205  8e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.87 
 
 
347 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.62 
 
 
352 aa  202  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  34.11 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6662  alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
344 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838814  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  34.42 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3068  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.16 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1176  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.62 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136787  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1700  threonine dehydrogenase  37.35 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.333284  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
354 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
365 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
354 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
354 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.94 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1742  D-xylulose reductase  36.62 
 
 
344 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.247806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
348 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.31 
 
 
346 aa  196  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.62 
 
 
344 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1653  putative D-xylulose reductase  36.62 
 
 
344 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.92 
 
 
333 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1076  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.62 
 
 
344 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.65 
 
 
354 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1235  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.62 
 
 
344 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0068  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.62 
 
 
344 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0351  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.62 
 
 
344 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773676  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
364 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5063  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.7 
 
 
344 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392538  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4382  alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
344 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5797  alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
344 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202299  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  36.2 
 
 
355 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.63 
 
 
350 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
362 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0551  D-xylulose reductase  37.24 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  34.24 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2163  alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.44 
 
 
345 aa  189  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  33.91 
 
 
362 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.74 
 
 
350 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
362 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  33.33 
 
 
363 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00942  hypothetical protein similar to L-arabitol dehydrogenase (Eurofung)  36.36 
 
 
386 aa  186  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.13 
 
 
352 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.14 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  33.04 
 
 
363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.15 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.44 
 
 
350 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.44 
 
 
350 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
350 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.44 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.44 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.44 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.14 
 
 
350 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.14 
 
 
350 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.03 
 
 
343 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 
373 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  33.13 
 
 
336 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.84 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.87 
 
 
373 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
373 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.57 
 
 
341 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40172  Sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  34.67 
 
 
381 aa  177  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.859827  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.14 
 
 
344 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  33.33 
 
 
375 aa  176  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.91 
 
 
351 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  29.56 
 
 
416 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.43 
 
 
348 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>