More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1043 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
353 aa  711    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  75.57 
 
 
355 aa  541  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  62.89 
 
 
360 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  61.47 
 
 
354 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  61.19 
 
 
354 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  61.19 
 
 
362 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  61.76 
 
 
354 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.47 
 
 
354 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  61.47 
 
 
365 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  60.62 
 
 
363 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.62 
 
 
354 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  60.91 
 
 
362 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  60.34 
 
 
363 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  60.91 
 
 
362 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  60.06 
 
 
364 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.59 
 
 
350 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  47.59 
 
 
350 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  47.59 
 
 
350 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.59 
 
 
350 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.59 
 
 
350 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  47.59 
 
 
350 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.31 
 
 
350 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  47.31 
 
 
350 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.31 
 
 
350 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.31 
 
 
350 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  45.33 
 
 
350 aa  285  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.5 
 
 
350 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  40.46 
 
 
353 aa  263  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.94 
 
 
351 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 
349 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 
350 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.81 
 
 
350 aa  258  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.07 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  39.27 
 
 
352 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  43.18 
 
 
349 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 
351 aa  245  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  41.53 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  37.1 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  43.02 
 
 
350 aa  242  7e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 
373 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
373 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
373 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.03 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
373 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.18 
 
 
373 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  38.53 
 
 
369 aa  227  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  36.39 
 
 
357 aa  225  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 
373 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
352 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2069  alcohol dehydrogenase  38.57 
 
 
352 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2380  alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.21 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 
353 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
343 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 
357 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
343 aa  215  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
343 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
343 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
343 aa  215  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
343 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  35.13 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.59 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
356 aa  212  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  37.33 
 
 
357 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.84 
 
 
373 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.434256  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
357 aa  209  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  36.49 
 
 
360 aa  206  5e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89701  polyol dehydrogenase  34.91 
 
 
385 aa  206  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  36.97 
 
 
340 aa  205  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.41 
 
 
340 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.16 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 
340 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  36.03 
 
 
357 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  35.29 
 
 
340 aa  195  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.78 
 
 
347 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.51 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  35.63 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.63 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  35.63 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  35.63 
 
 
347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  35.63 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  35.63 
 
 
347 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74116  Sorbitol dehydrogenase  32.63 
 
 
378 aa  181  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.58 
 
 
322 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  35.33 
 
 
347 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.84 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 
346 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  36.06 
 
 
347 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  35.65 
 
 
348 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  33.23 
 
 
359 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>