More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4159 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 350 aa  705    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.67 
 
 		 350 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.8 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.37 
 
 		 350 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  53.74 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  53.74 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  53.45 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.74 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.45 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  53.74 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  53.74 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  53.74 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  53.45 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  53.74 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.31 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  46.84 
 
 		 352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.02 
 
 		 373 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  47.46 
 
 		 373 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  45.3 
 
 		 354 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  45.01 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  45.98 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  45.38 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.3 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  45.3 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  45.3 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.01 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.44 
 
 		 351 aa  292  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  45.14 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  44.86 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  43.71 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  44 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  44.29 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  45.33 
 
 		 353 aa  285  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  44 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  43.14 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  42.74 
 
 		 353 aa  279  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  44.03 
 
 		 355 aa  278  8e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  44.86 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  43.47 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  47.73 
 
 		 351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.14 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  40.86 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  42.05 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.03 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  37.61 
 
 		 369 aa  246  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.75 
 
 		 358 aa  246  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  42.9 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 343 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 343 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 343 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 343 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 343 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  38 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.77 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  39.77 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  37.22 
 
 		 340 aa  235  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2380  alcohol dehydrogenase  41.48 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  36.86 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.14 
 
 		 340 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2069  alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 		 356 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  36.31 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  35.96 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  36.65 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  37.36 
 
 		 357 aa  212  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3841  alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 		 357 aa  205  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.55 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  37.36 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  35.71 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89701  polyol dehydrogenase  34.57 
 
 		 385 aa  192  5e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.92 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  33.84 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.62 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  33.81 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.13 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.71 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.54 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74116  Sorbitol dehydrogenase  34.48 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>