More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5001 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  85.68 
 
 		 373 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  86.86 
 
 		 373 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  87.13 
 
 		 373 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  98.66 
 
 		 373 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  86.86 
 
 		 373 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  740    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  87.13 
 
 		 373 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  60.97 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  62.11 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 		 350 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.35 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  43.34 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  43.34 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.63 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.34 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.34 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.06 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.06 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 		 350 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.06 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  43.06 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.06 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  42.66 
 
 		 365 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.66 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.09 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 		 354 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  40.96 
 
 		 360 aa  275  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.06 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  41.81 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  41.53 
 
 		 354 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  40.9 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  40.96 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  40.96 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  40.9 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  43.1 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  38.98 
 
 		 349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  40.17 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  39.32 
 
 		 349 aa  246  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  39.89 
 
 		 355 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  40.79 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.06 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  41.74 
 
 		 357 aa  232  9e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.155342 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  38.31 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.11 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  35.57 
 
 		 360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  39.61 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  35.59 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.31 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 		 343 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 		 343 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 		 343 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 		 343 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 		 343 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  40.83 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  34.93 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.56 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.2 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.2 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  39.83 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 		 357 aa  206  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.34 
 
 		 359 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  40.28 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  37.92 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.13 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.67 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.11 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  34.84 
 
 		 359 aa  186  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 348 aa  186  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2380  alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209062 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  32.74 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  34.65 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3841  alcohol dehydrogenase  38.94 
 
 		 350 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.7 
 
 		 343 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  32.74 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.74 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  32.74 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.15 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  32.74 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.15 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  32.45 
 
 		 347 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>