More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5726 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  95.44 
 
 
373 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  99.2 
 
 
373 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
373 aa  743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  87.13 
 
 
373 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  88.2 
 
 
373 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  743    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  87.13 
 
 
373 aa  627  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  61.54 
 
 
352 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  62.39 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.34 
 
 
350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.34 
 
 
350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  43.63 
 
 
350 aa  305  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  43.63 
 
 
350 aa  305  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.63 
 
 
350 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.63 
 
 
350 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  43.63 
 
 
350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.34 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.34 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.94 
 
 
350 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.93 
 
 
350 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.1 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  43.1 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.97 
 
 
354 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  43.59 
 
 
364 aa  278  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 
354 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 
354 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 
362 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  41.74 
 
 
362 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  41.74 
 
 
362 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.93 
 
 
350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  40.68 
 
 
360 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  41.24 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  40.96 
 
 
363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
350 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  40.56 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  40.34 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 
349 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  37.46 
 
 
349 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  38.46 
 
 
350 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  40.45 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  38.31 
 
 
369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.55 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.71 
 
 
356 aa  233  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 
353 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  35.57 
 
 
360 aa  232  9e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
351 aa  225  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 
357 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  34.93 
 
 
340 aa  222  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.37 
 
 
340 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  33.52 
 
 
340 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  38.83 
 
 
357 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  39.34 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.34 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  39.34 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  39.34 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  39.34 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  39.34 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.06 
 
 
343 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 
343 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.72 
 
 
346 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.2 
 
 
357 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
373 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.36 
 
 
353 aa  202  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 
356 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
341 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
341 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
341 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
341 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
341 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  37.92 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
341 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.69 
 
 
358 aa  195  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
357 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.35 
 
 
359 aa  193  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  35.58 
 
 
359 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  34.77 
 
 
348 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.08 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.11 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.28 
 
 
345 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.39 
 
 
336 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0341  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.15 
 
 
379 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.69 
 
 
347 aa  187  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  32.45 
 
 
347 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  33.6 
 
 
382 aa  186  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  32.74 
 
 
347 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  32.45 
 
 
347 aa  185  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.45 
 
 
347 aa  185  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  32.45 
 
 
347 aa  185  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  32.15 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.62 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  37.82 
 
 
343 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.15 
 
 
365 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.57 
 
 
373 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.434256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>