More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74116 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_74116  Sorbitol dehydrogenase  100 
 
 
378 aa  782    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89701  polyol dehydrogenase  51.84 
 
 
385 aa  383  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  35.9 
 
 
382 aa  226  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.52 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  33.78 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  33.42 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
353 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
373 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.07 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.76 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  32.89 
 
 
355 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
350 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
350 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
373 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.48 
 
 
350 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.48 
 
 
350 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  34.48 
 
 
350 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.48 
 
 
350 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.69 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.69 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.75 
 
 
350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.75 
 
 
350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 
350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  32.2 
 
 
362 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.2 
 
 
354 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  32.12 
 
 
363 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  32.03 
 
 
363 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  31.41 
 
 
360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
354 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.68 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
364 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
356 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
373 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.95 
 
 
350 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  30.81 
 
 
352 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 
357 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.07 
 
 
357 aa  149  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
340 aa  146  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
352 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.16 
 
 
350 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  31.35 
 
 
360 aa  143  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  30.85 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  30.75 
 
 
340 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.75 
 
 
340 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  28.19 
 
 
357 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  29.87 
 
 
340 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.04 
 
 
358 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 
373 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  27.59 
 
 
357 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  29.82 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
341 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
341 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
341 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
341 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
341 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
341 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  30.37 
 
 
350 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.93 
 
 
371 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.45 
 
 
341 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.93 
 
 
371 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2380  alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
354 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 
371 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.89 
 
 
373 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.434256  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  28.3 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  28.27 
 
 
359 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2069  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
352 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.6 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  29.87 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  26.79 
 
 
357 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.26 
 
 
347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  26.53 
 
 
358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3328  hypothetical protein  29.81 
 
 
338 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.463233 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4137  alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.31521  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  25.26 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4106  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.93 
 
 
336 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.82135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  28.83 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  27.18 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  27.59 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.39 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>